部門審計是內部審計的另一種主要形式，它是政府機構主管部門內部建立的審計機構對所屬單位和本部門財務收支和經濟效益所進行的經濟監督、評價活動。 開展部門內部審計有利于加強部門管理和控制。同時，部門審計對所屬的單位進行審計有較強的獨立性和權威性，又具有鮮明的行業特色。通過審計對整個部門的經濟活動有指導意義。因此也有利于擴大審計的影響。

部門審計機構可以對所屬單位內部審計人員進行業務培訓，組織交流，提供業務指導，有利于提高內部審計人員的素質。 部門審計在開展工作時，除了采用單位內部審計的方式外，還可根據部門審計的特點，采用部門調查、部門重點審計和整個部門審計等方式。 部門審計是一種內部審計，但針對單位內部審計而言，它具有外部審計的特征，它在審計的獨立性、審計結論的權威性、客觀性以及審計的組織方式等方面都與外部審計有相似之處。

另外，部門審計的內容往往是綜合的，并且可以通過一二個典型案例提高整個部門的工作，因此部門審計具有全面性和效益性的特點。部門審計可以在同一時間內對同一內容進行審計，審計結果的可比性較強，因此又具有統一性和專業性的特點。 部門審計隨著其作用的發揮，必然會越來越重要?？梢灶A計，作為聯系國家審計與單位內部審計的橋梁，部門審計將成為我國審計監督體系中的一個獨立的組成部分，發揮其更大的作用。