審計終結階段是指實施階段結束以后，審計人員根據審計工作底稿編制審計報告，并將有關文件整理歸檔的全過程。在國家審計中，審計的終結階段還包括做出審計結論和決定。
（一）編制審計報告
審計人員在完成外勤審計工作以后，就開始進入編制審計報告的階段，此階段的主要工作有：整理、評價執行審計業務中收集到的審計證據；復核審計工作底稿；審計期后事項；匯總審計差異；提請被審計單位調整或做適當批露；形成審計意見，撰寫審計報告。
 
（二）作出審計結論和決定
國家審計機關對被審計單位進行審查，如果發現存在嚴重違法亂紀問題，在簽發審計報告時，要做出審計結論和處理決定，責成被審計單位遵照執行，并通知財政、稅務、銀行等有關部門協助執行。對有關責任人員，審計機關應向其領導部門提出給予紀律處分的建議或移交有關部門處理。
審計機關在征求有關部門意見后，應依法獨立做出審計結論和處理決定。審計結論和處理決定具有法律效力，一經下達，被審計單位必須執行。
 
（三）審計資料的整理歸檔
終結階段的最后一項工作是對有關審計資料和文件的清理歸檔工作。審計人員應將向被審計單位調閱的資料全部歸還給被審計單位。對審計過程中積累的大量資料進行清理，將保存價值不大的資料剔除后銷毀，并將需要保存的資料編號后送交檔案部門歸檔保管。至此，該項審計工作基本結束。