貯藏保管對(duì)中藥材品質(zhì)亦有直接的影響。如果貯藏不當(dāng)，藥材就會(huì)產(chǎn)生不同程度的變質(zhì)現(xiàn)象，降低質(zhì)量和療效。
一、中藥貯藏保管中常見的變質(zhì)現(xiàn)象
（一）蟲蛀  藥材經(jīng)蟲蛀后，有的形成空洞，有的被毀成粉，破壞性甚強(qiáng)，應(yīng)注意防治。
（二）生霉  大氣中存在有多量的霉菌孢子，如散落在藥材表面，在適當(dāng)?shù)臏囟群蜐穸?
下，即萌發(fā)為菌絲，分泌酵素，溶蝕藥材的內(nèi)部組織，促使腐敗、變質(zhì)，失去藥效。
（三）變色  各種藥材都有其固有的顏色，如貯藏不當(dāng)，藥材本身含有的成分，經(jīng)過氧化、聚合作用或經(jīng)過分解、縮合等作用，產(chǎn)生有色化合物，使原來色澤加深或改變，以致變質(zhì)。
（四）走油  指某些含油藥材在貯藏不當(dāng)時(shí)油分向外溢出藥材表面，如柏子仁，或藥材在受潮、變色、變質(zhì)后表面呈現(xiàn)油樣物質(zhì)的變化，也稱為“走油”，如枸杞、麥冬等。
（五）自燃 
（六）其他  有些藥材在貯藏過程中所含有效成分會(huì)自然分解或起化學(xué)變化而降低療效，如綿馬貫眾、樟腦、冰片等，這類藥材不能久貯。

二、中藥的貯藏保管和害蟲防治
（一）倉(cāng)庫(kù)的管理  應(yīng)有嚴(yán)格的日常管理制度，保持經(jīng)常性的檢查，保證庫(kù)房干燥、清潔、通風(fēng)。注意外界溫度、濕度的變化，及時(shí)采取有效措施調(diào)節(jié)室內(nèi)溫度和濕度。藥材人庫(kù)前應(yīng)詳細(xì)檢查有無蟲蛀、生霉等情況。凡有問題的包件都應(yīng)進(jìn)行適當(dāng)?shù)奶幚恚挥泻细竦陌拍苋霂?kù)貯藏。貯藏的方法可根據(jù)藥材的特性分類保管。如劇毒藥與非毒性藥材分開，專人管理；容易吸濕霉變的藥材應(yīng)特別注意通風(fēng)干燥，必要時(shí)可翻曬或烘烤；含淀粉、蛋白質(zhì)、糖類等營(yíng)養(yǎng)成分容易蟲蛀的藥材，應(yīng)貯存于容器中，放置干燥通風(fēng)處，并經(jīng)常檢查，必要時(shí)進(jìn)行滅蟲處理；少數(shù)資重藥材也應(yīng)與一般藥材分開，專人管理，有的應(yīng)密閉貯存，勤于檢查，防霉、防蛀。
（二）害蟲的防治 
1．貯藏   在中藥貯藏保管方面，人們積累了很多好的，如牡丹皮與澤瀉放在一起，牡丹皮不易變色，澤瀉不易蟲蛀；花椒、細(xì)辛、畢澄茄（山蒼子）、樟腦、大蒜都可單獨(dú)與有腥氣的動(dòng)物藥一起存放，可防蟲；白酒的蒸氣能使害不易生存，也可直接灑酒在藥材上；有些藥材可暫時(shí)放入石灰缸或理入谷糠中保存，避免受潮。
2．利用溫度貯藏
   （1）用低溫方法，藥材害蟲一般在環(huán)境溫度 8～15℃時(shí)停止活動(dòng)，在－4～8℃時(shí)，即進(jìn)入冬眠狀態(tài)，溫度低于－4℃，經(jīng)過一定時(shí)間，可以使害蟲致死。不但能防蟲，亦可防霉，防變色、走油等。
   （2）用高溫方法，藥材害蟲對(duì)高溫的抵抗力較差，當(dāng)環(huán)境溫度在40～45℃時(shí)，害蟲就停止發(fā)育、繁殖。溫度升到48~52℃時(shí)，害蟲將在短時(shí)間內(nèi)死亡。注意烘烤藥材溫度不直超過60℃，含揮發(fā)油的藥材不宜烘烤，以免影響質(zhì)量。
3．化學(xué)藥劑處理 用于藥材殺蟲的藥劑必須揮發(fā)性強(qiáng)，有強(qiáng)烈的滲透性，能滲人包裝內(nèi)，效力確實(shí)，作用迅速，可在短時(shí)間內(nèi)殺滅一切害蟲和蟲卵，殺蟲后能自動(dòng)揮散而不永遠(yuǎn)沾附在藥材上，并且對(duì)人的毒性小，對(duì)藥材的質(zhì)量沒有影響。較常用的殺蟲劑有：氯化苦（化學(xué)名為三氯硝基甲烷）、磷化鋁、二氧化硫。
近年來國(guó)內(nèi)采用的新技術(shù)有氣調(diào)貯藏（氣調(diào)養(yǎng)護(hù)）和60鉆輻射滅菌。氣調(diào)養(yǎng)護(hù)是調(diào)節(jié)庫(kù)內(nèi)氣體成分，充氮或二氧化碳，降低氧氣，使害蟲缺氧而死，60鈷射線有較強(qiáng)的滅菌能力。